НДС: выполнение НИОКР на территории России

Выполнение НИОКР учреждениями образования и научными организациями на территории России освобождено от налогообложения НДС не зависимо от того, какая именно организация выполняет эти работы: иностранная или российская (пп. 16 п. 3 ст. 149 Налогового кодекса РФ).
Налогоплательщики вправе отказаться от освобождения от НДС тех операций, которые перечислены в пункте 3 статьи 149 Налогового кодекса РФ. Для этого необходимо представить соответствующее заявление в налоговый орган по месту регистрации в качестве налогоплательщика (п. 5 ст. 149 Налогового кодекса РФ). Но на иностранные организации это не распространяется, так как они не стоят на учете в российских налоговых органах и не предоставляют туда никакие документы.

Такие разъяснения приведены в письме Минфина России от 11 августа 2014 № 03-07-08/39794.