По вопросу возврата сумм налога на доходы физических лиц в соответствии со статьей 34.2 Налогового кодекса Минфин России в письме от 17 октября 2012 г. № 03-04-05/10-1198 разъяснил ситуацию, когда работнику для приобретения жилья была предоставлена материальная помощь. В случае досрочного увольнения работника согласно дополнительному соглашению к трудовому договору материальная помощь должна быть возвращена организации пропорционально отработанному времени.
В связи с увольнением работника до истечения трехлетнего срока и возвратом части суммы материальной помощи, уменьшенной на сумму удержанного налога, у налогового агента образовалась переплата налога на доходы физических лиц.
Указанная переплата может быть возвращена в порядке статьи 78 Налогового кодекса, которой установлен порядок зачета или возврата сумм излишне уплаченного налога.