ФНС России в письме от 15 сентября 2015 г. № ГД-4-3/16258@ дала разъяснения по вопросу представления налоговой декларации по налогу на прибыль организаций по обособленным подразделениям некоммерческой организации (казенного учреждения), у которой не возникает обязательств по уплате данного налога.
Налогоплательщики, независимо от наличия у них обязанности по уплате налога и (или) авансовых платежей по налогу, особенностей исчисления и уплаты налога, обязаны представлять в налоговые органы по месту своего нахождения и месту нахождения каждого обособленного подразделения налоговые декларации в порядке, определенном статьей 289 Налогового кодекса (п. 1 ст. 289 НК РФ). Некоммерческие организации, у которых не возникает обязательств по уплате налога, представляют налоговую декларацию по упрощенной форме по истечении налогового периода (п. 2 ст. 289 НК РФ).
В письме сделан вывод, что законодательство не содержит положений, свидетельствующих об освобождении некоммерческих организаций от представления налоговых деклараций, составленных по итогам налогового периода, в налоговые органы по месту нахождения обособленных подразделений.