Нецелевое использование бюджетных средств

Государственным органом исполнительной власти в сфере финансового контроля была проведена проверка в отношении бюджетного учреждения и выявлена сумма нецелевого использования бюджетных средств в части предоставления субсидии на финансовое обеспечение выполнения государственного задания (неправомерные начисления по заработной плате). По решению учреждения за счет финансового обеспечения от приносящей доход деятельности (КФО 2) денежные средства были перечислены в доход бюджета в размере выявленного нецелового использования (нарушение условий соглашения о предоставлении субсидии), согласно представлению

Может ли учреждение самостоятельно принять решение о погашении данной задолженности перед бюджетом за счет средств от приносящей доход деятельности? Является ли это причинением ущерба государственному учреждению? Какие дальнейшие действия учреждения и учредителя? Каким образом это отразить в бухгалтерском учете, в том числе в плане финансово-хозяйственной жизни?