НДС с НИОКР

Выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ за счет средств бюджетов, в том числе федерального бюджета, не облагается НДС (подп. 16 п. 3 ст. 149 НК РФ). Нормами Налогового кодекса перечень документов, подтверждающих право на применение указанного освобождения, не установлен.
Основанием для освобождения от обложения НДС научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, выполняемых за счет средств федерального бюджета, могут являться договор на выполнение работ с указанием источника финансирования, письменное уведомление заказчика, которому выделены средства непосредственно из федерального бюджета, в адрес исполнителей и соисполнителей о выделенных целевых бюджетных средствах для оплаты научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ и т.п. (письмо Минфина России от 12 августа 2009 г. № 03-07-11/203).