Пропуск налоговым органом срока взыскания сумм налога влечет утрату возможности взыскания соответствующих пеней. Соответственно, в случае исключения из совокупной обязанности сумм налогов, по которым истек срок их взыскания, исключению также подлежат суммы начисленных пеней.
В целях формирования единой правоприменительной практики по вопросу исключения из совокупной обязанности налогоплательщика задолженности по пеням, начисленным на недоимку, в отношении которой установлен пропуск срока взыскания, необходимо руководствоваться определенными правилами. Например, если задолженность по налогу, по которому установлен пропуск срока взыскания, исключена из совокупной обязанности налогоплательщика в соответствии с подпунктом 2 пункта 7 статьи 11.3 Налогового кодекса, задолженность по пеням, начисленным на данную недоимку, подлежит исключению из сальдо ЕНС до даты вступления в законную силу судебного акта о восстановлении пропущенного срока либо судебного акта о взыскании таких сумм (письмо ФНС России от 2 августа 2024 г. № Д-5-08/66@).